Международная группа ученых опубликовала в журнале Nature Genetics последовательность генома яблони. Эти данные помогут в дальнейшем выводить новые сорта яблонь, лучше адаптированных у определенным условиям и требованиям, за более короткий срок. Предполагается, что новые разновидности будут не только устойчивы к болезням, на них также будут произрастать более качественные плоды с лучшими потребительскими свойствами. Таким образом, выращивание яблок новых сортов станет более устойчивым как с экологической, так и с экономической точки зрения.
Над изучением геномной последовательности работал международный консорциум исследовательских учреждений Франции, Италии, Германии, Нидерландов и Южной Африки. Геном яблони содержит более 42 тысяч генов. Ученые получили высокое качество описания генома удалось получить благодаря новейшей методике секвенирования. Эта методика позволяет генерировать длинные последовательности ДНК определенных сортов яблони. Благодаря ей была составлена наиболее информативная генетическая карта этой культуры.
Опубликованная последовательность генома дает новое представление об организации генов яблони. 93% из 42 тысяч генов, предположительно влияющих на качественные свойства сортов, были уже проверены с использованием секвенирования РНК. Новые данные необходимы для идентификации генов, представляющих интерес в процессе выведения яблонь с определенными свойствами. Кроме того, новые данные будут применяться для разработки диагностических тестов на основе ДНК, которые помогут ускорить выведение новых сортов.
Ключом к успеху исследования стало использование дигаплоидного (имеющего два набора повторяющихся хромосом в ядре клетки) сорта яблони. Эта культура имеет перекрестный тип опыления и гетерозиготный геном. Яблоня выводилась путем гибридизации двух разновидностей, геномные последовательности которых вместе формируют полную дупликацию генов. Каждое дерево несет четыре варианта последовательности ДНК. Особенность же дигаплоидного сорта - наличие только двух вариантов каждой последовательности. Простота такого генома позволила сгенерировать последовательность высокого качества.
Процесс изучения геномной последовательности координировал Этьен Бушер из INRA-Angers (Франция). Исследователи из Университета и исследовательского центра Вагенингена внесли свой вклад в общий результат, проведя крупномасштабный анализ ДНК (секвенирование генома), проанализировав разработку и применением биоинформации. Они также предоставили исследователям доступ к неопубликованной генетической карте яблони.
В Университете и исследовательском центре Вагенинген выводят и исследуют новые сорта яблони. Среди созданных учеными сортов - «Elstar» и «Santana», а также новинка рынка «Natyra». Поскольку «Santana» и «Natyra» устойчивы к болезням, они хорошо подходят для органического сельского хозяйства. Преимуществом сорта «Santana» является то, что его плоды могут употреблять в пищу люди с легкой аллергией на яблоки.
Вагенинген намерен использовать новое понимание ДНК яблок для целевого выращивания новых сортов, уделяя особое внимание устойчивости.
Финансовую поддержку исследованию оказали Европейская комиссия и несколько национальных учреждений по субсидированию.
Источник: FruitNews по материалам FreshPlaza
